荆功超
导师类别: 产业导师
职 称: 助理研究员
职 务: 助理研究员
学历(学位): 硕士
单位名称: 中国科学院青岛生物能源与过程研究所
研究方向: 人工智能、数据挖掘、数据库
联系方式: jinggc@qibebt.ac.cn
基本信息
荆功超,2013年毕业于青岛科技大学获得工学硕士学位,2013年开始在中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心工作主要从事生物信息相关研究。研究工作致力于解决一个核心科学问题,即微生物大数据挖掘,并围绕着这一科学问题,分别从开发关键算法工具、构建核心数据平台、创新科研模式及开展广泛合作应用四个方面具体展开工作,在每一项工作中也有相应的论文产出或者实际合作产出且对于更快、更准地挖掘微生物数据中隐含的重要信息提供工具,具有重要的参考价值。目前以第一作者或共同一作第一位次已在Bioinformatics、mSystems等发表论文5篇,参与论文多篇。 在研主持国家重点研发计划项目子课题一项,结题国家自然科学基金青年项目,山东省自然科学基金青年基金项目及国家其他项目和各种横向项目多项。
学习研究经历
• 2010/09–2013/06 青岛科技大学,计算机应用专业,硕士
• 2013/07–至今 ,中国科学院青岛生物能源与过程研究所,单细胞中心,助理研究员
主要研究方向
人工智能、数据挖掘、数据库
教科研项目
1. 国家重点研发计划子课题,2022年 - 2027年,105.0万元,在研
2. 国家自然科学基金-青年基金项目,2021年 - 2023年,24.0 万元,结题
3. 国家其他任务,2021年 - 2023年,30.0万元,结题
4. 山东自然科学基金-青年基金项目,2020年 - 2022年,15.0万元,结题
5. 宝洁公司-横向课题,2016年 - 2020年,40.0万元,结题
论文论著专利
代表性论文
1. 共同一作(第一位次): Dynamic Meta-Storms enables comprehensive taxonomic and phylogenetic comparison of shotgun metagenomes at the species level. Bioinformatics 2019
2. 共同一作(第一位次): Microbiome Search Engine 2: a Platform for Taxonomic and Functional Search of Global Microbiomes on the Whole-Microbiome Level. mSystems 2021
3. 共同一作(第一位次): A Scale-Free, Fully Connected Global Transition Network Underlies Known Microbiome Diversity. mSystems 2021
4. 第一作者:Meta-Apo improves accuracy of 16S-amplicon-based prediction of microbiome function. BMC Genomics 2021
5. 第一作者:Parallel-META 3: Comprehensive taxonomical and functional analysis platform for efficient comparison of microbial communities. Sci. Rep. 2017